Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fgf1P61148 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fgf1P61148 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms