Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2iP60898 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2iP60898 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms