Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rhbdl3P58873 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rhbdl3P58873 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms