Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CtdsplP58465 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CtdsplP58465 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms