Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smpdl3bP58242 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smpdl3bP58242 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms