Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tm9sf2P58021 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tm9sf2P58021 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms