Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn18P56857 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn18P56857 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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