Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TdgP56581 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TdgP56581 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TdgP56581 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TdgP56581 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TdgP56581 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TdgP56581 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TdgP56581 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TdgP56581 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TdgP56581 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms