Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gp1bbP56400 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gp1bbP56400 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms