Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtskP55097 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtskP55097 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtskP55097 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtskP55097 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtskP55097 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtskP55097 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtskP55097 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms