Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Aqp4P55088 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Aqp4P55088 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms