Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NrlP54846 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrlP54846 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrlP54846 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NrlP54846 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NrlP54846 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NrlP54846 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NrlP54846 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NrlP54846 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrlP54846 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrlP54846 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrlP54846 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrlP54846 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms