Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Faf1P54731 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Faf1P54731 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms