Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CnbpP53996 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
CnbpP53996 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms