Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PitpnbP53811 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PitpnbP53811 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PitpnbP53811 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PitpnbP53811 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PitpnbP53811 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms