Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PctpP53808 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PctpP53808 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PctpP53808 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms