Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RabggtbP53612 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RabggtbP53612 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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