Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cux1P53564 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cux1P53564 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cux1P53564 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms