Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upp1P52624 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Upp1P52624 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Upp1P52624 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms