Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ube2e3P52483 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms