Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apobec1P51908 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apobec1P51908 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms