Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccr5P51682 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccr5P51682 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms