Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr4P51680 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccr4P51680 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms