Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MipP51180 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MipP51180 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MipP51180 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MipP51180 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MipP51180 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MipP51180 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MipP51180 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MipP51180 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MipP51180 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms