Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmod1P49813 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmod1P49813 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms