Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psen1P49769 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms