Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpcP49452 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CenpcP49452 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CenpcP49452 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CenpcP49452 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms