Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtpreP49446 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PtpreP49446 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PtpreP49446 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PtpreP49446 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PtpreP49446 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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PtpreP49446 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtpreP49446 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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