Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbp3P49194 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbp3P49194 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms