Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CitP49025 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CitP49025 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CitP49025 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CitP49025 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CitP49025 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CitP49025 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CitP49025 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CitP49025 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CitP49025 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CitP49025 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CitP49025 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms