Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnni3P48787 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tnni3P48787 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms