Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GdnfP48540 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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GdnfP48540 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GdnfP48540 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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