Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sox2P48432 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sox2P48432 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms