Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfx2P48379 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rfx2P48379 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms