Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TgfaP48030 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TgfaP48030 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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