Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CratP47934 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CratP47934 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CratP47934 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CratP47934 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CratP47934 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CratP47934 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CratP47934 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms