Protein–RNA interactions for Protein: P47911

Rpl6, 60S ribosomal protein L6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl6P47911 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl6P47911 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl6P47911 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms