Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gli1P47806 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gli1P47806 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms