Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccr7P47774 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr7P47774 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms