Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SrprbP47758 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrprbP47758 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SrprbP47758 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms