Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf1P46099 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms