Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-6P43688 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx2-6P43688 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms