Protein–RNA interactions for Protein: P41158

Elk4, ETS domain-containing protein Elk-4, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk4P41158 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Elk4P41158 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Elk4P41158 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms