Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Grik2P39087 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms