Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col18a1P39061 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col18a1P39061 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms