Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sar1aP36536 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sar1aP36536 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms