Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PtprkP35822 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PtprkP35822 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PtprkP35822 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PtprkP35822 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms