Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ptpn1P35821 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ptpn1P35821 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms