Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ly6dP35459 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ly6dP35459 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms