Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp12P34960 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mmp12P34960 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms